平成１７年４月１日より「電子申請システム」の運用が開始されました。これにより、税理士（会員）及び一般利用者による申請がインターネットから行うことができます。
１．利用可能時間
毎日、午前７時〜午後１０時まで（ただし、システムの定期保守日などの場合、停止することがあります）
２．電子申請システムへのログインの方法
３．電子申請で利用可能な手続き
| 区分 | 申請種別 | 次のステップへのリンク |
| 税理士（会員） | 変更登録申請 | 次の説明へ進む |
| 証票再交付申請（亡失・損壊・その他） | ||
| 登録抹消届出 | 次の説明へ進む | |
| 法人設立届出（主たる事務所） | 次の説明へ進む | |
| 法人設立届出（従たる事務所） | ||
| 法人変更届出（主たる事務所） | ||
| 法人変更届出（従たる事務所） | ||
| 法人解散届出 | ||
| 法人合併届出 | ||
| 総会招集通知参照 | 次の説明へ進む | |
| 紛議の調停の請求 | 次の説明へ進む | |
| 一般利用者 | 新規登録申請 | 現在は対応しておりません |
| 紛議の調停の請求 | 次の説明へ進む |